L’Institut français de recherche sur le Japon à la Maison franco-japonaise publie la revue Ebisu. Études japonaises, à raison d’un numéro par an. Il co-édite et soutient également des publications scientifiques en sciences humaines, majoritairement sur le Japon, notamment les ouvrages issus de manifestations scientifiques organisées à l’Institut, ainsi que les travaux de ses chercheurs titulaires et associés.